故事以TV版为基础,战斗所剩下的骑士只有六人:城户真司(龙骑)、秋山莲(夜骑)、北冈秀一(钢兵),浅仓威(王蛇),雾岛美穗(FEMME)和神秘的龙牙RYUGA。雾岛美穗成为骑士的目的是要杀死浅仓为姊姊报仇,并令姊姊复活。而北冈正是帮浅仓脱去杀人罪的律师,他因内疚而多次帮助美穗,可惜美穗并不接受,令他意兴阑珊的退出骑士之间的战斗。为了报仇的美穗不理真司的阻止,仍多次与浅仓战斗,却反而令自己陷入危机,当浅仓向美穗下毒手时,龙牙突然出现解救美穗,并以强大的力量将王蛇压倒,令美穗成功杀死浅仓。由於美穗以为是真司救了她,便相约他出来吃东西希望报答他,而真司和美穗的感情亦得以发展,可惜这个美好时刻却被邪恶的龙牙破坏。镜世界中的真司(RYUGA)假冒真正的真司袭击美穗,美穗於是与龙牙战斗但不敌,虽然美穗被真司所救,但最後因伤重而死…。另一方面取回小时候的记忆的优衣,知道神崎士郎发动战斗的目的是为了自己(详情请看TV版剧情简介的部份),於是她决定以自杀来阻止神崎士郎的疯狂行为。另外真司亦知道自己是小时候间接害死优衣的人,令他感到非常内疚。此时镜世界中的真司出现,并欺骗真司说和他合体可拯救优衣,合体後的龇牙以最强Rider的身份向放夜骑作出挑战。得悉优衣已死的神崎士郎受不了打击,在痛哭嚎叫下消失了,镜世界中的成千上万蜻蜓怪因而失控,飞到现实世界袭击人类。战斗中的夜骑与龙牙终於发现优衣的屍体,在这个冲击下真司竟从龙牙的身体中分裂出来,并和龙牙作宿命决战。最後真司和莲变身成SURVIVE形态,骑著契约兽飞向成千上万的蜻蜓怪,与它们作最後决战,走向未知的未来…。
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